1. Sebagai unit induk, berperanan menjadi penyelaras dengan memberi perkhidmatan bantuan kepada unit-unit lain.
2. Bertanggungjawab secara keseluruhan kepada urusan penyelenggaraan semua bangunan/ ruang pejabat dan kemudahan-kemudahan lain yang berada di bawah kawalan JAHEAIK.
3. Merancang serta mengadakan satu sistem pentadbiran yang sistematik, dinamik dan adil dengan tujuan mewujudkan satu jabatan yang sempurna.
4. Melaksanakan tugas-tugas pentadbiran am, perkhidmatan kakitangan/ pegawai, keselamatan dokumen, mengawal selia semua peringkat kakitangan, termasuk latihan dan kebajikan mereka.
5. Menyelaras segala kegiatan Jabatan dengan beberapa agensi luar seperti Jabatan-jabatan Agama Negeri, Mufti-mufti Kerajaan, JAKIM dan PERKIM.
6. Menyalur data dan maklumat rasmi kepada Bahagian-bahagian lain, terutama yang menyentuh perihal dasar baru atau pindaannya – lazimnya yang dikeluarkan oleh pihak berkuasa negeri dari semasa ke semasa

KETAKWAAN TERAS KEMULIAAN

Nilai Bersama

J : Jaringan

     (Jalinan kerjasama, hubungan, komunikasi)

A : Amanah

      (Ikhlas, jujur, telus, benar, boleh percaya)

H : Hubungan Pelanggan

      (Perkhidmatan berkualiti, layanan mesra, senyuman, ramah)

E : Ehsan

     ( Cemerlang - berkualiti, dedikasi, cekap, komited dan positif)

A : Akauntabiliti

     ( Bertanggungjawab, berdisiplin, telus)

I : Integriti

    ( Trampil, bersih hati, wibawa, budi pekerti, peribadi mulia, taat setia, patuh, berwawasan)

K : Kerja Berpasukan

     ( Berpadu tenaga, kerjasama, tolong menolong, strategik dan berwawasan)

• Warna Merah : Berani Membuat Keputusan.
• Warna Kuning : Agama Islam di bawah naungan Tuanku Al-Sultan.
• Warna Putih : Suci, Arif dan Bijaksana.
• Kepelbagaian warna : Islam untuk semua bangsa dan warna kulit.
• Bentuk Bulatan : Islam memenuhi keperluan sejagat.
• 1950 : Tahun Penubuhan Awal Pejabat Agama.
• Buku : Berasaskan ilmu dan menyebarkannya.
• Bintang Bersudut 5 : Merujuk kepada 5 Pelan Transformasi Ummah iaitu Faqihan, Aminan, Rahiman, Ilman & Salaman.
• Bintang Pecahan 10 : Mempunyai cawangan pejabat agama di 10 jajahan.
• Bulan Sabit : Kedaulatan Islam.
• 2 Jata Negeri : Merujuk kepada sebuah jabatan di bawah kerajaan Negeri.
• Kubah Masjid : Melambangkan budaya masyarakat yang kuat beragama sesuai dengan jolokan Serambi Mekah.
• Tulisan Jawi : Melambangkan sebuah jabatan yang bergerak seiring dengan Peredaran masa dan berani membuat perubahan.
• Tulisan JAHEAIK : Merupakan Akronim untuk Jabatan Hal Ehwal Agama Islam Negeri Kelantan